Molekulinės mikrobiologijos ir biotechnologijos skyrius

2023

1. Daliri E. B.-M., T. Balnionytė, J. Stankevičiūtė, E. Lastauskienė, R. Meškys, A. Burokas. 2023. High temperature lacto-fermentation improves antioxidant and antidiabetic potentials of Lithuanian red beetroot. LWT – Food Science and Technology 185: 115122.
2. Fuchs J., R. Jamontas, M.H. Hoock, J. Oltmanns, B. Golinelli-Pimpaneau, V. Schuenemann, A.J. Pierik, R. Meškys, A. Aučynaitė, M. Boll. 2023. TudS desulfidases recycle 4-thiouridine-5'-monophosphate at a catalytic [4Fe-4S] cluster. Communications Biology 6(1): 1092.
3. Gabrielaitis D., V. Žitkutė, L. Saveikytė, G. Labutytė, M. Skapas, R. Meškys, V. Časaitė, A. Sasnauskienė, U. Neniškytė. 2023. Nanotubes from bacteriophage tail sheath proteins: internalisation by cancer cells and macrophages. Nanoscale Advances 5(14): 3705-3716.
4. Malunavičius V., A. Padaiga, J. Stankevičiūtė, A. Pakalniškis, R. Gudiukaitė. 2023. Engineered Geobacillus lipolytic enzymes - attractive polyesterases that degrade polycaprolactones and simultaneously produce esters. International Journal of Biological Macromolecules 253(8): 127656
5. Megur A., E.B.-M. Daliri, T. Balnionytė, J. Stankevičiūtė, E. Lastauskienė, A. Burokas. 2023. In vitro screening and characterization of lactic acid bacteria from Lithuanian fermented food with potential probiotic properties. Frontiers in Microbiology 14:1213370.
6. Noreika A., R. Rutkienė, I. Dumalakienė, R. Vilienė, A. Laurynėnas, S. Povilonienė, M. Skapas, R. Meškys, L. Kalinienė. 2023. Insights into the alcyoneusvirus adsorption complex. International Journal of Molecular Sciences 24(11): 9320.
7. Noreika A., J. Stankevičiūtė, R. Rutkienė, R. Meškys, L. Kalinienė. 2023. Exploring the enzymatic activity of depolymerase gp531 from Klebsiellapneumoniae jumbo phage RaK2. Virus Research 336: 199225
8. Preitakaitė V., P. Barasa, A. Aučynaitė, G. Plakys, M. Koplūnaitė, S. Zubavičiūtė, R. Meškys. 2023. Bacterial amidohydrolases and modified 5-fluorocytidine compounds: novel enzyme-prodrug pairs. Plos One 18(11): e0294696
9. Sadauskas M., M. Jakutis, V. Petkevičius, M. Malikėnas, V. Preitakaitė, J. Vaitekūnas, R. Meškys. 2023. Biocatalytic synthesis of asymmetric water-soluble indirubin derivatives. Dyes and Pigments 219: 111585.
10. Statkevičius R., J. Vaitekūnas, R. Stanislauskienė, R. Meškys. 2023. Metagenomic type IV aminotransferases active toward (R)-methylbenzylamine. Catalysts 13(3): 587.
11. Šimoliūnas E., M. Šimoliūnienė, G. Laskevičiūtė, K. Kvederavičiūtė, M. Skapas, A. Kaupinis, M. Valius, R. Meškys, N. Kuisienė. 2023. Geobacillus bacteriophages from compost heaps: representatives of three new genera within thermophilic siphoviruses. Viruses-Basel 15(8): 1691.
12. Urbelienė N., M. Tiškus, G. Tamulaitienė, R. Gasparavičiūtė, R. Lapinskaitė, V. Jauniškis, J. Sūdžius, R. Meškienė, D. Tauraitė, E. Skrodenytė, G. Urbelis, J. Vaitekūnas, R. Meškys. 2023. Cytidine deaminases catalyze the conversion of N( S, O)4-substituted pyrimidine nucleosides. Science Advances 9(5): eade4361.

2022

1.  Imklin N., P. Chaengphaniad, E. Šimoliūnas, R. Nasanit. 2022. A novel Staphylococcus phage, vB_Sau-RP15, and its application in contaminated milk. Letters in Applied Microbiology. DOI 10.1093/lambio/ovac003. IF 2.813.
2. Juškauskas A., A. Zajančkauskaitė, R. Meškys, M. Ger, A. Kaupinis, M. Valius, L. Truncaitė. 2022. Interaction between phage T4 protein RIII and host ribosomal protein S1 inhibits endoribonuclease RegB activation. International Journal of Molecular Sciences 23(16): 9483. IF 6,208.
3. Koplūnaitė M., K. Butkutė, D. Špelveris, N. Urbelienė, R. Meškys. 2022. Enzymatic synthesis of modified nucleoside 5′-monophosphates. Catalysts 12(11), 1401. IF 4,501
4. Petkevičius V., J. Vaitekūnas, M. Sadauskas, F. P. Schultes, D. Tischler, R. Meškys. 2022. The versatility of non-heme diiron monooxygenase PmlABCDEF: a single biocatalyst for a plethora of oxygenation reactions. Catalysis Science & Technology DOI 10.1039/d2cy01167k IF 6,177
5. Plakys G., R. Gasparavičiutė, J. Vaitekūnas, R. Rutkienė, R. Meškys. 2022. Characterization of Paenibacillus sp. GKG endo-beta-1, 3-glucanase, a member of family 81 glycoside hydrolases. Microorganisms 10 (10): 1930. IF 4.926 
6. Shafaat A., R. Žalneravičius, D. Ratautas, M. Dagys, R. Meškys, R. Rutkienė, J.F. Gonzalez-Martinez, J. Neilands, S. Bjorklund, J. Sotres, T. Ruzgas. 2022. Glucose-to-resistor transduction integrated into a radio-frequency antenna for chip-less and battery-less wireless sensing. ACS Sensors 7(4): 1222-1234. IF 9,618 Q1D1 Chem anal Q1 chem multid Q1 nanos nanotechn
7. Statkevičiūtė R., M. Sadauskas, J. Rainytė,  K. Kavaliauskaitė, R. Meškys. 2022. Comparative analysis of mesophilic YqfB-type amidohydrolases. Biomolecules 12(10): 1492. IF 6.064 
8. Šarlauskas J., J. Stankevičiūtė, J. Tamulienė. 2022. An efficient synthesis and preliminary investigation of novel 1,3-dihydro-2h-benzimidazol-2-one nitro and nitramino derivatives Materials 15(23): 8330. IF 3.748 
9. Tetianec L., I. Bratkovskaja, V. Časaitė, V. Gurevičienė, J. Razumienė, J. Stankevičiūtė, R. Meškys, M. Dagys, A. Laurynėnas. 2022. Efficient bi-enzymatic synthesis of aldonic acids. Green Chemistry 24(12): 4902-4908. IF 11.034.

2021

1. Kalinienė L., A. Noreika, A. Kaupinis, M. Valius, E. Jurgelaitis, J. Lazutka, R. Meškienė, R. Meškys. 2021. Analysis of a novel bacteriophage vB_AchrS_AchV4 highlights the diversity of Achromobacter viruses. Viruses 13(3): 374. IF 5,818 
2. Krikštaponis A., G. Urbelis,  R. Meškys. 2021. The first step of biodegradation of 7-hydroxycoumarin in Pseudomonas mandelii 7HK4 depends on an alcohol dehydrogenase-type enzyme. International Journal of Molecular Sciences. 22(4): 1552.  IF 6,208 
3. Labutytė G., S. Povilonienė, E. Šimoliūnas, D. Gabrielaitis, M. Skapas, A. Noreika, R. Meškys, V. Časaitė. 2021. Functionalized protein nnotubes based on the bacteriophage vB_KleM-RaK2 tail sheath protein. Nanomaterials 11(11): 3031. IF 5.719 
4. Lastauskienė E., V. Valskys, J. Stankevičiūtė, V. Kalcienė, V. Gėgžna, J. Kavoliunas, M. Ružauskas, J. Armalytė. 2021. TThe impact of intensive fish farming on pond sediment microbiome and antibiotic resistance gene composition.Frontiers in Veterinary Science 8: 673756 IF 3,471
5. Petkevičius V., J. Vaitekūnas, R. Gasparavičiūtė, D. Tauraitė, R. Meškys. 2021. An efficient and regioselective biocatalytic synthesis of aromatic N-oxides by using a soluble di-iron monooxygenase PmlABCDEF produced in the Pseudomonas species. Microbial Biotechnology 14(4): 1771-1783. IF 6,575
6. Radveikienė I., R. Vidžiūnaitė, R. Meškienė, R. Meškys, V. Časaitė. 2021. Characterization of a yellow laccase from Botrytis cinerea 241. Journal of Fungi 7(2): 143. IF 5,724
7. Repečka D., V. Jauniškis, L. Karpus, E. Rembeza, I. Rokaitis, J. Zrimec, S. Povilonienė, A. Laurynėnas, S. Viknander, W. Abuajwa, O. Savolainen, R. Meškys, M. K. M. Engqvist, A. Zelezniak. 2021. Expanding functional protein sequence spaces using generative adversarial networks. Nature Machine Intelligence 3(4): 324-333. IF 25.898 
8. Rinkūnaitė I., Eg. Šimoliūnas, D. Bironaitė, R. Rutkienė, V. Bukelskienė, R. Meškys, J. Bogomolovas. 2021. The effect of a unique region of Parvovirus B19 capsid protein VP1 on endothelial cells. Biomolecules 11 (4):606. IF 6,064
9. Savickaitė A., G. Druteika, M. Sadauskas, V. Malunavičius, E. Lastauskienė, R. Gudiukaitė. 2021. Immobilized GDEst-95, GDEst-lip and GD-95RM lipolytic enzymes for continuous flow hydrolysis and transesterification reactions. International Journal of Biological Macromolecules 168: 261-271. IF 8,025 
10. Savickaitė A., M. Sadauskas, R. Gudiukaitė. 2021. Study of individual domains' functionality in fused lipolytic biocatalysts based on Geobacillus lipases and esterases. International Journal of Biological Macromolecules 173: 421-434. IF 8,025
11. Šakinytė I., M. Butkevičius, V. Gurevičienė, J. Stankevičiūtė, R. Meškys, J. Razumienė.2021. Reagentless D-tagatose biosensors based on the oriented immobilization of fructose dehydrogenase onto coated gold nanoparticles- or reduced graphene oxide-modified surfaces: application in a prototype bioreactor. Biosensors-Basel 11(11): 466. IF 5,743 
12. Šimoliūnienė M., D. Kazlauskas, A. Zajančkauskaitė, R. Meškys L.Truncaitė. 2021. Escherichia coli trxA gene as a molecular marker for genome engineering of felixounoviruses. Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects 1865(10): 129967. IF 4,117
13. Šimoliūnienė M., E. Žukauskienė, L.Truncaitė, L. Cui, G. Hutinet, D. Kazlauskas, A. Kaupinis, M. Skapas, V.d. Crécy-Lagard, P.C.Dedon, M. Valius, R. Meškys, E. Šimoliūnas. 2021. Pantoea bacteriophage vB_PagS_MED16—A siphovirus containing a 2′-deoxy-7-amido-7-deazaguanosine-modified DNA. International Journal of Molecular Sciences 22: 7333. IF 6,208 
14. Šulčius S., G. Alzbutas, V. Juknevičiūtė, E. Šimoliūnas, P. Venckus, M. Šimoliūnienė, R. Paškauskas. 2021. Exploring viral diversity in a gypsum karst lake ecosystem using targeted single-cell genomics. Genes 12(6): 886. IF 4.141
15. Voitechovic E., J. Stankevičiūtė, A.Vektarienė, G. Vektaris, R. Jančienė, N. Kuisienė, J. Razumienė, R. Meškys. 2021. Bioamperometric systems with fructose dehydrogenase from Gluconobacter japonicus for D-tagatose. Electroanalysis 33(6): 1393-1397. IF 3,077 
16. Zajančkauskaitė A., A. Noreika, R. Rutkienė, R. Meškys, L. Kalinienė. 2021. Low-temperature virus vB_EcoM_VR26 shows potential in biocontrol of STEC O26:H11. Foods 10(7): 1500. IF 5.561 
17. Zhou J., L. Pecqueur, A. Aučynaitė, J. Fuchs, R. Rutkienė, J. Vaitekūnas, R. Meškys, M. Boll, M. Fontecave, J. Urbonavičius, B. Golinelli-Pimpaneau. 2021. Structural evidence for a [4Fe‐5S] intermediate in the non‐redox desulfuration of thiouracil. Angewandte Chemie International Edition 60: 424-431 IF 16,823 
18. Zilius M., A. Samuilovienė, R. Stanislauskienė, E. Broman, S. Bonaglia, R. Meškys, A. Zaiko. 2021. Depicting temporal, functional and phylogenetic patterns in estuarine diazotrophic communities from environmental DNA and RNA. Microbial Ecology 81: 36-51.IF 4,192
19. Žukauskienė E., M. Šimoliūnienė, L. Truncaitė, M. Skapas, A. Kaupinis, M. Valius, R. Meškys, E. Šimoliūnas. 2021. Pantoea bacteriophage vB_PagS_AAS23: a singleton of the Genus Sauletekiovirus. Microorganisms 9(3): 668. IF 4.926

2020

1. Časaitė V., R. Stanislauskienė, J. Vaitekūnas, D. Tauraitė, R. Rutkienė, R. Gasparavičiūtė, R. Meškys. 2020. Microbial degradation of pyridine: a complete pathway deciphered in Arthrobacter sp. 68b. Applied and Environmental Microbiology 86(15): e00902-20. IF 4.79
2. Druteika G., M. Sadauskas, V. Malūnavičius, E. Lastauskienė, L. Taujenis, A. Gegeckas, R. Gudiukaitė. 2019. Development of a new Geobacillus lipase variant GDlip43 via directed evolution leading to identification of new activity-regulating amino acids. International Journal of Biological Macromolecules 151: 1194-1204 IF 6.953
3. Druteika G., M. Sadauskas, V. Malūnavičius, E. Lastauskienė, R. Statkevičiūtė, A. Savickaitė, R. Gudiukaitė. 2020. New engineered Geobacillus lipase GD-95RM for industry focusing on the cleaner production of fatty esters and household washing product formulations. World Journal of Microbiology&Biotechnology 36(3): 41. IF 3.31
4. Gružauskaitė J., J. Jasinskaitė, R. Meškys, G. Gaidamavičienė, A. Žalga, A. Laurynėnas, L. Tetianec, M. Dagys. 2020. Gold-coated magnetic nanocatalyst containing wired oxidoreductases for mediatorless catalysis of carbohydrate oxidation by oxygen. Catalysis Communications 135: AN 105848 IF 3.62
5. Koplūnaitė M., K. Butkutė, R. Meškys, D. Tauraitė. 2020. Synthesis of pyrimidine nucleoside and amino acid conjugates. Tetrahedron Letters 61(49): AN 152598. IF 2.415
6. Kumar A., R. Gudiukaitė, A. Gricajeva, M. Sadauskas, V. Malunavičius, H. Kamyab, S. Sharma, T. Sharma, D. Pant. 2020. Microbial lipolytic enzymes - promising energy-efficient biocatalysts in bioremediation. Energy 192: 116674. IF 7,147
7. Kuznecova J., S. Šulčius, A. Vogts, M. Voss, K. Jürgens, E. Šimoliūnas. 2020. Nitrogen flow in diazotrophic cyanobacterium aphanizomenon flos-aquae is altered by cyanophage infection. Frontiers in Microbiology. 11: AN 2010.IF 5,639
8. Leonavičienė G., K. Leonavičius, R. Meškys, L. Mažutis. 2020. Multi-step processing of single cells using semi-permeable capsules. Lab on a Chip 20 (21): 4052-4062. IF 6,799
9. Noreika A., R. Meškys, J. Lazutka, L. Kalinienė. 2020. Complete genome sequence of Buttiauxellaphage vB_ButM_GuL6. Archives of Virology D166(11): 2685-2687. IF 2,574
10. Ramašauskas L., R. Meškys, D. Ratautas. 2020. Real-time glucose monitoring system containing enzymatic sensor and enzymatic reference electrodes. Biosensors and Bioelectronics 164: 112338. IF 10.61
11. Sadauskas M., R. Statkevičiūtė, J. Vaitekūnas, V. Petkevičius, V. Časaitė, R. Gasparavičiūtė, R. Meškys. 2020. Enzymatic synthesis of novel water-soluble indigoid compounds. Dyes and Pigments 173: AN 107882 IF 4.889
12. Sadauskas M., R. Statkevičiūtė, J. Vaitekūnas, R. Meškys. 2020. Bioconversion of Biologically Active Indole Derivatives with Indole-3-Acetic Acid-Degrading Enzymes from Caballeronia glathei DSM50014. Biomolecules 10: 663 IF 4.879
13. Stanislauskienė R., A. Laurynėnas, R. Rutkienė, A. Aučynaitė, D. Tauraitė, R. Meškienė, N. Urbelienė, A. Kaupinis, M. Valius, L. Kalinienė, R. Meškys. 2020. YqfB protein from Escherichia coli: an atypical amidohydrolase active towards N4-acylcytosine derivatives. Scientific Reports 10:788. IF 4.37
14. Šimoliūnienė M., L. Truncaitė, E. Petrauskaitė, A. Zajančkauskaitė, R. Meškys, M. Skapas, A. Kaupinis, M. Valius, E. Šimoliūnas. 2020. Pantoea agglomerans-infecting bacteriophage vB_PagS_AAS21: a cold-adapted virus representing a novel genus within the family Siphoviridae. Viruses 12: 479. IF 5.048
15. Šimoliūnienė M., D. Tumėnas, K. Kvederavičiūtė, R. Meškys, S. Šulčius, E. Šimoliūnas. 2020. Complete genome sequence of Bacillus cereus bacteriophage vB_BceS_KLEB30-3S. Microbiology Resource Announcements 9: AN e00348-20
16. Truncaitė L., M. Šimoliūnienė, L. Alijošius, E. Petrauskaitė, L. Kiaušaitė, R. Meškys, M. Skapas, E. Šimoliūnas. 2020. Complete genome analysis of Pantoea agglomerans-infecting bacteriophage vB_PagM_AAM22. Archives of Virology 165(9): 2111-2114. IF 2.574
17. Urbelienė N., R. Meškienė, M. Tiškus, R. Stanislauskienė, A. Aučynaitė, A. Laurynėnas, R. Meškys. 2020. A rapid method for the selection of amidohydrolases from metagenomic libraries by applying synthetic nucleosides and a uridine auxotrophic host. Catalysts 10: 445. IF 4.146
18. Vaitekūnas J., R. Gasparavičiūtė, J. Stankevičiūtė, G. Urbelis, R. Meškys. 2020. Biochemical and genetic analysis of 4-hydroxypyridine catabolism in Arthrobacter sp. strain IN13. Microorganisms 8: 888. IF 4.128

1. Petkevičius V., J. Vaitekūnas, D. Tauraitė, J. Stankevičiūtė, D. Vaitkus, J. Šarlauskas, N. Čėnas, R. Meškys. Whole-Cell Biocatalysis Using PmlABCDEF Monooxygenase and Its Mutants: A Versatile Toolkit for Selective Synthesis of Aromatic N-Oxides. In Applied Biocatalysis: The Chemist’s Enzyme Toolbox, 528-533. Ed. J. Whittall, P. Sutton, John Wiley&Sons Ltd.

2019

1. Časaitė V., M. Sadauskas, J. Vaitekūnas, R. Gasparavičiūtė, R. Meškienė, I. Skikaitė, M. Sakalauskas, J. Jakubovska, D. Tauraitė, R. Meškys. 2019. Engineering of a chromogenic enzyme screening system based on an auxiliary indole-3-carboxylic acid monooxygenase. MicrobiologyOpen 8: e00795. IF 3,412
2. Ferrer M., C. Méndez-García, R. Bargiela, J. Chow, S. Alonso, A. García-Moyano, G.E.K. Bjerga, I. H. Steen, T. Schwabe, C. Blom, J. Vester, A. Weckbecker, P. Shahgaldian, C.C.C.R. de Carvalho, R. Meškys, G. Zanaroli, F.O. Glöckne, A. Fernández-Guerra, S. Thambisetty, F. de la Calle, O.V. Golyshina, M.M Yakimov, K.E. Jaeger, A.F. Yakunin, W.R. Streit, O. McMeel, J.B. Calewaert, N. Tonné, P.N. Golyshin. 2019. Decoding the ocean's microbiological secrets for marine enzyme biodiscovery. FEMS Microbiology Letters 366: fny285. IF 1.987
3. Gineitytė J., R. Meškys, M. Dagys, D. Ratautas. 2019. Highly efficient direct electron transfer bioanode containing glucose dehydrogenase operating in human blood. Journal of Power Sources 441: 227163 IF 8,247
4. Gordeeva J., N. Morozova, N. Sierro, A. Isaev, T. Sinkunas, K. Tsvetkova, M. Matlashov, L. Truncaitė, R.D. Morgan, N. V. Ivanov, V. Siksnys, L. Zeng, K. Severinov. 2019. BREX system of Escherichia coli distinguishes self from non-self by methylation of a specific DNA site. Nucleic Acid Research. 47: 253-265. IF 11.501
5. Jakubovska J., D. Tauraitė, R. Meškys. 2019. Transient N4‐acyl‐DNA protection against the cleavage by restriction endonucleases. ChemBioChem 20: 2504-2512. IF 2.576
6. Kazlauskas A., A. Darinskas, R. Meškys, A. Tamašauskas, J. Urbonavičius. 2019. Isocytosine deaminase Vcz as a novel tool for the prodrug cancer therapy. BMC Cancer 19: 197. IF 3,15
7. Krikštolaitytė V., J. Hamit-Eminowski, L. Abariūtė, G. Niaura, R. Meškys, T. Arnebrant, G. Lisak, T. Ruzgas. 2019. Impact of molecular linker size on physicochemical properties of assembled gold nanoparticle mono-/multi-layers and their applicability for functional binding of biomolecules. Journal of Colloid and Interface Science 543: 307-316 IF 7,489
8. Petkevičius V., J. Vaitekūnas, D. Tauraitė, J. Šarlauskas, N. Čėnas, R. Meškys. 2019. A biocatalytic synthesis of heteroaromatic N‐oxides by whole cells of Escherichia coli expressing the multicomponent, soluble di‐iron monooxygenase (SDIMO) PmlABCDEF. Advanced Synthesis&Catalysis 361: 2456-2465. IF 5.851
9. Petkevičius V., J. Vaitekūnas, D. Vaitkus, N. Čėnas, R. Meškys. 2019. Tailoring a soluble diiron monooxygenase for synthesis of aromatic N-oxides. Catalysts 9: 356 IF 3.52
10. Ramonas E., D. Ratautas, M. Dagys, R. Meškys, J. Kulys. 2019. Highly sensitive amperometric biosensor based on alcohol dehydrogenase for determination of glycerol in human urine. Talanta 200: 333-339. IF 5.339
11. Šimoliūnas E., L. Truncaitė, R. Rutkienė, S. Povilonienė, K. Goda, A. Kaupinis, M. Valius, R. Meškys. 2019. The robust self-assembling tubular nanostructures formed by gp053 from by gp053 from Phage vB_EcoM_FV3. Viruses 11: AN 50. IF 3.816
12. Špakova A., E. Šimoliūnas, R. Batiuškaitė, S. Pajeda, R. Meškys, R. Petraitytė-Burneikienė. 2019. Self-assembly of tail tube protein of bacteriophage vB_EcoS_NBD2 into extremely long polytubes in vB_EcoS_NBD2 into Extremely Long Polytubes in E. coli and S. cerevisiae. Viruses-Basel 11: AN208.  IF 3.816
13. Šulčius S., E. Šimoliūnas, G. Alzbutas, G. Gasiūnas, V. Jauniškis, S. Miettinen, E. Nilsson, R. Meškys, E. Roine, R. Paškauskas, K.Holmfeldt. 2019. Genomic characterization of cyanophage vB_AphaS-CL131 infecting filamentous diazotrophic cyanobacterium Aphanizomenon flos-aquae reveals novel insights into virus-bacterium interactions. Applied and Environmental Microbiology 85: UNSP e01311-18. IF 4.016
14. Urbelienė N., S. Kutanovas, R. Meškienė, R. Gasparavičiūtė, D. Tauraitė, M. Koplūnaitė, R. Meškys. 2019. Application of the uridine auxotrophic host and synthetic nucleosides for a rapid selection of hydrolases from metagenomic libraries. Microbial Biotechnology 12: 148-160. IF 5,328
15. Vaitkutė G., I. Bratkovskaja, V. Časaitė, J. Stankevičiūtė, R. Meškys, L. Tetianec. 2019. Electron transfer mediators for PQQ dependent soluble glucose dehydrogenase catalyzed lactose oxidation reaction. Chemija 30: 194-200. IF 0.305

2018

1. Ratautas, D., Ramonas, E., Marcinkevičienė, L., Meškys, R. and Kulys, J., 2018. Wiring Gold Nanoparticles and Redox Enzymes: A Self‐Sufficient Nanocatalyst for the Direct Oxidation of Carbohydrates with Molecular Oxygen. ChemCatChem, 10(5), pp.971-974.

2. Petkevičius, V., Vaitekūnas, J., Stankevičiūtė, J., Gasparavičiūtė, R. and Meškys, R., 2018. Catabolism of 2-hydroxypyridine by Burkholderia sp. MAK1: a five-gene cluster encoded 2-hydroxypyridine 5-monooxygenase HpdABCDE catalyses the first step of biodegradation. Applied and environmental microbiology, pp.AEM-00387.

3. Mikalkėnas, A., Ravoitytė, B., Tauraitė, D., Servienė, E., Meškys, R. and Serva, S., 2018. Conjugation of phosphonoacetic acid to nucleobase promotes a mechanism-based inhibition. Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry, 33(1), pp.384-389.

4. Kaliniene, L., Truncaitė, L., Šimoliūnas, E., Zajančkauskaitė, A., Vilkaitytė, M., Kaupinis, A., Skapas, M. and Meškys, R., 2018. Molecular analysis of the low-temperature Escherichia coli phage vB_EcoS_NBD2. Archives of virology, 163(1), pp.105-114.

5. Aučynaitė, A., Rutkienė, R., Gasparavičiūtė, R., Meškys, R. and Urbonavičius, J., 2018. A gene encoding a DUF523 domain protein is involved in the conversion of 2‐thiouracil into uracil. Environmental microbiology reports, 10(1), pp.49-56.

6. Urbelienė, N., Kutanovas, S., Meškienė, R., Gasparavičiūtė, R., Tauraitė, D., Koplūnaitė, M. and Meškys, R., 2018. Application of the uridine auxotrophic host and synthetic nucleosides for a rapid selection of hydrolases from metagenomic libraries. Microbial biotechnology.

7. Šulčius, S., Šimoliūnas, E., Alzbutas, G., Gasiūnas, G., Jauniškis, V., Kuznecova, J., Miettinen, S., Nilsson, E., Meškys, R., Roine, E. and Paškauskas, R., 2018. Genomic characterization of cyanophage vB_AphaS-CL131 infecting filamentous diazotrophic cyanobacterium Aphanizomenon flos-aquae reveals novel insights into virus-bacterium interactions. Appl. Environ. Microbiol., pp.AEM-01311.

8. Šulčius, S., Mazur-Marzec, H., Vitonytė, I., Kvederavičiūtė, K., Kuznecova, J., Šimoliūnas, E. and Holmfeldt, K., 2018. Insights into cyanophage-mediated dynamics of nodularin and other non-ribosomal peptides in Nodularia spumigena. Harmful algae, 78, pp.69-74.

9. Šimoliūnas, E., Šimoliūnienė, M., Kaliniene, L., Zajančkauskaitė, A., Skapas, M., Meškys, R., Kaupinis, A., Valius, M. and Truncaitė, L., 2018. Pantoea Bacteriophage vB_PagS_Vid5: A Low-Temperature Siphovirus That Harbors a Cluster of Genes Involved in the Biosynthesis of Archaeosine. Viruses, 10(11), p.583.

10. Šimkus, R., Meškienė, R., Aučynaitė, A., Ledas, Ž., Baronas, R. and Meškys, R., 2018. Phoretic interactions and oscillations in active suspensions of growing Escherichia coli. Royal Society open science, 5(5), p.180008.

11. Stanislauskienė, R., Kutanovas, S., Kalinienė, L., Bratchikov, M. and Meškys, R., 2018. Tetramethylpyrazine-Inducible Promoter Region from Rhodococcus jostii TMP1. Molecules, 23(7), p.1530.

12. Krikštaponis, A. and Meškys, R., 2018. Biodegradation of 7-Hydroxycoumarin in Pseudomonas mandelii 7HK4 via ipso-Hydroxylation of 3-(2, 4-Dihydroxyphenyl)-propionic Acid. Molecules, 23(10), p.2613.

13. Jakubovska, J., Tauraitė, D. and Meškys, R., 2018. A versatile method for the UVA-induced cross-linking of acetophenone-or benzophenone-functionalized DNA. Scientific reports, 8(1), p.16484.

14. Jakubovska, J., Tauraitė, D., Birštonas, L. and Meškys, R., 2018. N4-acyl-2′-deoxycytidine-5′-triphosphates for the enzymatic synthesis of modified DNA. Nucleic acids research.

15. Aučynaitė, A., Rutkienė, R., Tauraitė, D., Meškys, R. and Urbonavičius, J., 2018. Identification of a 2′-O-Methyluridine Nucleoside Hydrolase Using the Metagenomic Libraries. Molecules, 23(11), p.2904.

16. Aučynaitė, A., Rutkienė, R., Tauraitė, D., Meškys, R. and Urbonavičius, J., 2018. Discovery of bacterial deaminases that convert 5-fluoroisocytosine into 5-fluorouracil. Frontiers in Microbiology, 9.

Nacionaliniai projektai

Centrinės projektų valdymo agentūros administruojami projektai

2014-2020 m. ES fondų investicijų veiksmų programa „Kompetencijos centrų ir inovacijų ir technologijų perdavimo centrų veiklos skatinimas“ 

• "Naujos kartos industrinių fermentų inžinerijos centras (TVIRTAS)", Nr. 01.2.2-CPVA-K-703-03-0023, prof. Rolandas Meškys, 2020-2023

2014-2020 m. ES fondų investicijų veiksmų programa

„Aukšto lygio tyrėjų grupių vykdomi moksliniai tyrimai (SMART)“

• "Fermentų įrankinė fukozilintų oligosacharidų sintezei", Nr. 01.2.2-LMT-K-718-03-0045, 2020-2023, dr. Jonita Stankevičiūtė
• "Selektyvi fermentinė provaistų aktyvavimo sistema", Nr. 01.2.2-LMT-K-718-03-0082, 2020-2023, prof. Rolandas Meškys.

Nacionalinė mokslo programa „Sveikas senėjimas“ 

• "Savaime susirenkantys fagų baltymai tikslinei nanomedicinai", projekto vadovė dr. Vida Časaitė, 2020-2021.
• "Naujos provaistų aktyvavimo sistemos vėžio genoterapijoms", dr. J. Urbonavičius, 2015-2018 m.

Nacionalinė mokslo programa „Agro-, miško ir vandens ekosistemų tvarumas" 

• "Agroekosistemų mikrobiota klimato kaitos sąlygomis: struktūra ir dermės mechanizmai", dr. E. Servienė (GTC), projekto BCHI dalies vadovė dr. L. Kalinienė, 2015-2018 m.

Nacionalinė mokslo programa „Sveikas ir saugus maistas“ 

• "Patogeninių bakterijų detekcija maisto grandinėje molekuliniais metodais", dr. E. Sužiedėlienė, VU GMF, projekto vykdytojas dr. R. Meškys, 2012-2015 m.
• "Naujo tipo prebiotinių oligosacharidų kūrimas termofilinių fermentų pagalba", dr. R. Meškys (projekto vykdytojas VU GMF, dr. N. Kuisienė), 2011-2014 m.

ES programa „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)”

• "Keiskis arba mirk: oksidoreduktazių perkonstravimas", mokslinis vadovas dr. R. Meškys, 2013-2015 m.

Mokslininkų grupių projektai

• "Sierą metabolizuojančių bakteriofagų įvairovė ir paplitimas", projekto vadovas dr. Eugenijus Šimoliūnas, 2020-2022.
• "Šaltamėgių bakteriofagų adaptacijos mezofiliniam šeimininkui molekuliniai mechanizmai", projekto vadovė dr. Laura Kalinienė, 2019-2022.
• "Bakteriofagų vaidmuo reguliuojant azoto apykaitą melsvabakterėse: nuo ląstelių iki bendrijos", dr. S. Šulčius, Gamtos tyrimų centras, projekto BCHI dalies vadovas dr. E. Šimoliūnas, 2017-2020 m.
• "Atmosferinio azoto fiksacijos vaidmuo didžiausioje eutrofikuotoje Europos lagūnoje", dr. M. Žilius, Klaipėdos universitetas, projekto BCHI dalies vadovė dr. R. Stanislauskienė. 2017-2020 m.
• "Naujų fermentų, dalyvaujančių modifikuotųjų uracilo heterociklinių bazių ir nukleozidų katabolizme, paieška ir tyrimas", dr. J. Urbonavičius, 2015-2018 m.
• "Proteogenominiai Escherichia coli virulentinių bakteriofagų ankstyvųjų infekcijos stadijų tyrimai", dr. L. Truncaitė, 2014-2016 m.
• "Baeyer-Villiger monooksigenazių atrankos ir biosintezės metodų kūrimas", dr. R.Meškys, 2012-2014 m.
• "tRNR modifikavimo keliai - fermentų evoliucijos atspindys", dr. J. Urbonavičius, 2012-2014 m.
• "Piridinų ir pirazinų biodegradacija ir biokatalizinė sintezė", dr. R. Meškys, 2011-2012 m.