Projektas: Vilniaus universiteto Gyvybės mokslų centro Biotechnologijos institute vykdomas projektas „CRISPR molekulinių įrankių išplėtimas keliančių grėsmę SARS-CoV-2 variantų greitam aptikimui ir genominės įvairovės stebėjimui“, projekto Nr. 13.1.1-LMT-K-718-05-0021 finansuojamas Europos regioninės plėtros fondo lėšomis kaip Europos Sąjungos atsako į COVID-19 pandemiją priemonė Nr. 13.1.1-LMT-K-718 „Tiksliniai moksliniai tyrimai sumanios specializacijos srityje“.
Projekto trukmė: nuo 2021-11-04 iki 2023-09-01.
Mokslinio tyrimo vadovas: vyresnysis mokslo darbuotojas Darius Kazlauskas.
Projekto tikslas: išplėsti CRISPR molekulinių įrankių įvairovę ir pritaikyti juos greitai SARS-CoV-2 variantų detekcijai bei plitimo stebėjimui. Šis rezultatas bus svarbus sumaniosios specializacijos srityje „Molekulinės technologijos medicinai ir biofarmacijai“, nes mūsų tyrimai gali padėti suvaldyti dabartinius ir būsimus virusų protrūkius ar pandemijas. Greitas ir prieinamas būdas nustatyti vieno nukleotido polimorfizmus taip pat yra svarbus tiksliajai medicinai, kai vaistai skiriami pagal unikalius žmogaus genomo variantus. C2EP grįsta detekcija gali būti naudojama ir kitose srityse, kur šiuo metu naudojami sekoskaitos metodai, pavyzdžiui, teismo ekspertizėje.
Siekiamas rezultatas: numatomi du pagrindiniai šio projekto rezultatai, kurie bus toliau naudojami jį baigus. Pirma, bus sukaupta vertingų žinių apie C2EP įvairovę ir tai, kaip jie atpažįsta nukleorūgštis. Remdamasi tuo, projekto komanda parengs straipsnį ir pateiks jį aukštą citavimo indeksą turinčio (Q1) žurnalo redakcijai.
Antra, bus sukurtas SARS-CoV-2 VOC detekcijos sistemos prototipas. Užbaigus projektą, projekto komanda planuoja pateikti patento paraišką naujam C2EP, kurį naudojant būtų galima nustatyti vieno nukleotido mutaciją.
Pasiekti rezultatai: sukurtas SARS-CoV-2 VOC detekcijos sistemos prototipas bei parengtas straipsnis (https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.27.534365v2), kuris pateiktas Q1 žurnalo redakcijai