Oportunistinės bakterijos kelia pavojų visuomenės sveikatai, ypač imunosupresuotiems asmenims. Genominė oportunistinių bakterijų analizė leidžia geriau suprasti jų evoliuciją, plitimą, atsparumo antibiotikams vystymąsi bei tai valdyti. Nors oportunistiniai patogenai tokie kaip Pseudomonas aeruginosa, Mycobacterium tuberculosis ar Klebsiella pneumoniae plačiai tiriami pasauliniu mastu, Lietuvoje trūksta išsamių tyrimų apie jų genominę įvairovę ir evoliuciją. Nepaisant didelio paplitimo, ypač mažai žinoma apie oportunistinių bakterijų, tokių kaip M. tuberculosis, įvairovę žmogaus organizme bei tos įvairovės kitimą infekcijos eigoje. Šie tyrimai įgalins įžvalgas apie patogenų adaptaciją, virulentiškumą ir atsparumą gydymui.
Šio doktorantūros projekto tikslas – bioinformatiniais metodais tirti oportunistinių patogenų genominę įvairovę žmogaus organizme bei tarp žmonių, siekiant suprasti bakterijų genominę evoliuciją, adaptaciją ir perdavimo būdus. Naudojant sekoskaitos duomenis ir naujausius bioinformatinius metodus, bus siekiama nustatyti, kaip genetinė įvairovė šeimininko organizme lemia bakterijų gebėjimą išvengti imuninės sistemos atsako, kokie yra pagrindiniai atsparumo vystymosi mechanizmai ir kokie veiksniai lemia chroninių infekcijų vystymąsi. Tikimasi, kad šie tyrimai prisidės prie gydymo strategijų tobulinimo ir efektyvesnių visuomenės sveikatos intervencijų, skirtų oportunistinių bakterinių infekcijų valdymui.
Mokslinis vadovas / supervisor: dr. Miglė Gabrielaitė
Kontaktai / Contacts:
tel. / phone: +370 64842767
Mokslo kryptis: Biologija N 010