RNR virusai yra greičiausiai evoliucionuojantys baltymus koduojantys organizmai. Šių virusų įvairovė yra milžiniška ir nuolat papildoma metagenominių tyrimų, tačiau vis dar trūksta tyrimų detaliau charakterizuojančių naujai atrastus RNR virusus. Šio projekto uždavinys yra atpažinti dažniausiai pasaulyje sutinkamus RNR virusus, ieškoti jų viešuose sekoskaitos duomenų šaltiniuose ir esant galimybei atlikti jų sekoskaitą Lietuvoje ir likusiame pasaulyje. Gauti duomenys būtų sujungti su kitų grupių sekoskaitos duomenimis, surinktais iš viešai prieinamų sekoskaitos duomenų bazių, ir analizuojami filogenetiniais metodais taikomais genominėje epidemiologijoje siekiant geriau suprasti šių virusų evoliuciją ir ekologiją sąlygojančius veiksnius.
Idealūs kandidatai turėtų būti susipažinę su sekoskaitos bibliotekų ruošimu laboratorijoje, sekoskaitos duomenų apdorojimu, mokėti programuoti Python ar R kalbomis bei atlikti filogenetines analizes. Kadangi šis projektas apima skirtingus ir ne visai susijusius gebėjimus, tinkami kandidatai gali turėti vien laboratorinių ar vien kompiuterinių žinių, tuomet trūkstamų įgūdžių bus išmokta doktorantūros metu.
Mokslinis vadovas / supervisor: dr. Gytis Dudas
Kontaktai / Contacts:
tel. / phone: +370 656 36243
Mokslo kryptis: Biologija N 010