5-metilcitozinas (m5C) yra pagrindinė žinduolių genomo epigenetinė žymė, atliekanti svarbų vaidmenį reguliuojant genų raišką bei palaikant genomo stabilumą. DNR metilinimą žinduolių ląstelėse katalizuoja DNR metiltransferazių šeima (DNMT1, DNMT3A ir DNMT3B), pasižyminti geba pernešti metilo grupę nuo S-adenozil-L-metionino (AdoMet) ant CpG sekoje esančio citozino. Koordinuotas visų trijų DNMT šeimos baltymų veikimas yra būtinas embriono vystymuisi, o mutacijos ar raiškos pokyčiai skatina įvairių patologijų (pvz. vėžio) atsiradimą bei progresavimą. Tačiau individualus šių fermentų indėlis ląstelių procesuose lieka menkai suprastas. Todėl tiek molekulinių elementų, reguliuojančių DNR metilinimą ląstelėse, tiek molekulinių įrankių, kurie padėtų tiksliau įvertinti DNR metilinimo pokyčius, formuojamus pavienių DNR metiltransferazių ląstelių diferenciacijos ar suvėžėjimo procesų metu, tolesnis tyrinėjimas ir plėtojimas išlieka svarbūs. Visai neseniai pristatyta Dnmt-TOP-seq metodika, leidžianti tiesiogiai identifikuoti CpG sritis, specifiškai modifikuojamas pelės DNMT1 ir DNMT3A metiltransferazių gyvose ląstelėse naudojant sintetinius AdoMet analogus. Tikėtina, kad tolesnis šio inovatyvaus metodo vystymas ir taikymas leis atskleisti naujus DNR metiltransferazių molekulinius ryšius įvairių biologinių procesų metu.
Mokslinis vadovas / Supervisor: dr. Vaidotas Stankevičius
Kontaktai / Contacts:
tel. / phone: +37068313680
Mokslo kryptis: Biochemija N 004