Orthomyxoviridae šeimos atstovai, tai virusai turintys apvalkalėlį ir segmentuotą viengrandinės atvirkštinės krypties RNR genomą. RNR virusų paieškų metodai turi trūkumų: negeba nustatyti, ar virusai užkrečia šeimininką ar mikrobinį pakeleivį žarnyne, ar atpažinti virusų audinių tropizmą. Pavienių uodų ląstelių transkriptomos analizė gali išspręsti šiuos iššūkius ir tą padaryti turint vos vieną teigiamą mėginį. Šio projekto tikslas yra atlikti pavienių Culex uodų ląstelių transkriptomos sekoskaitą, identifikuoti naujus RNR virusus, jų šeimininkus ir audinių tropizmą. Koreliuojant uodų transkriptomą su virusų buvimu, bus hipotezuojami virusų receptoriai ir atlikta ortomiksovirusų filogenominė analizė. Išanalizavus pavienių ląstelių transkriptomas galėsime sudaryti uodų „audinių žemėlapius“ ir nustatyti kurie iš jų yra užkrėsti ir kokiais virusais. Naujai atrasti RNR virusai bus peržiūrėti ir aprašyti: šeimininkas, genomo sandara, skaitymo rėmeliai, virusų grupė, paplitimas audiniuose. Be to pasinaudojant pseudovirusų platforma bus charakterizuojami naujų virusų paviršiaus baltymų gebėjimas inicijuoti infekciją tikslinėms ląstelėms.
Mokslinis vadovas / Supervisor: Dr. Milda Norkienė
Kontaktai / Contacts:
tel. / phone: +37067434539
Mokslo kryptis: Biochemija N 004.