Irmantas Mogila apgynė disertaciją „III tipo CRISPR-Cas aktyvumo reguliacijos mechanizmo tyrimai ir susijusių transliaciją slopinančių efektorių charakterizavimas” ir jam buvo suteiktas biochemijos mokslo krypties daktaro laipsnis.
Moksliniai konsultantai: dr. Gintautas Tamulaitis (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija); prof. dr. Virginijus Šikšnys (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija); dr. Giedrė Tamulaitienė (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija.
Disertacijos gynimo tarybos sudėtis: Tarybos pirmininkas - prof. dr. Saulius Serva (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija); doc. dr. Vasili Hauryliuk (Lundo universitetas, Švedija, gamtos mokslai, biochemija), dr. Patrick Pausch (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija), prof. dr. Edita Sužiedelienė (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biochemija), doc. dr. Marijonas Tutkus (Vilniaus universitetas, gamtos mokslai, biofizika).
Prokariotinės CRISPR-Cas sistemos suteikia adaptyvią apsaugą nuo virusinių nukleorūgščių. Gerai charakterizuoti yra III-A tipo CRISPR-Cas kompleksai vadinami Csm, kurie sunaikina svetimą RNR. Šiame darbe buvo siekiama papildyti dabartinį Csm aktyvumo modelį naujomis įžvalgomis apie III-A tipo sistemų deaktyvaciją ir nustatyti pagalbinių baltymų funkcijas.
Atlikti fluorescencijos koreliacijos spektroskopijos matavimai atskleidė, kad greitos RNR hidrolizės produktai daugiau negu valandą užlaikomi komplekse. Užlaikyta RNR stimuliuoja komplekso Cas10 subvieneto DNazinį aktyvumą, kuris nuslopinamas RNR disociavus.
Cas10 baltymai taip pat sintetina ciklinius oligoadenilatus (cAn), kurie aktyvina pagalbinius CARF efektorius. Sekų analizė atskleidė, kad CARF domenai evoliucijos eigoje susiliejo su mRNR interferaziniu aktyvumu pasižyminčiais RelE domenais susidarant Cami1 baltymams. Darbe siekta charakterizuoti šiuos efektorius. Biocheminiai ir in vivo toksiškumo tyrimai atskleidė, kad Cami1 hidrolizuoja mRNR ir stabdo bakterijų augimą, kai yra aktyvinami cA4. Cami1 CARF domenai hidrolizuoja savo aktyvatorius. Struktūriniai Cami1 baltymų tyrimai atskleidė, kad šie baltymai patenka į ribosomas per stiebo baltymą bL12. Tokia sąveika tarp ribosomos stiebo ir transliaciją slopinančio toksino prokariotuose yra stebima pirmą kartą.
 |
| Nuotr. Raimundo Šuikos |