Proteomika

Dalyko pavadinimas

Mokslo kryptis kodas

Kamieninis padalinys

Šakinis padalinys (-iai)

Proteomika

Biochemija N 004

Gyvybės mokslų centras

Biochemijos Institutas

Dalyko apimtis kreditais

8

Studijų būdas

Kreditų skaičius

Studijų būdas

Kreditų skaičius

paskaitos

0

konsultacijos

1

individualus

7

seminarai

0

Kurso tikslai

Doktorantų žinių apie proteomikos metodus ir technologijas gilinimas, jų panaudojimo bei taikymo galimybių išmanymas įvairiose tyrimų srityse (biomedicinos, farmacijos, mikrobiologijos, žemės ūkio, aplinkotyros, biotechnologijos ir kt.).

Pagrindinės temos

Proteomikos tipai (struktūrinė, funkcinė, raiškos proteomika), proteomo nustatymo metodologijos, baltymų išskyrimas iš ląstelių kultūrų ir audinių bei jų frakcionavimas, organelių proteomika, baltymų skirstymas ir vaizdinimas, baltymų paruošimo masių spektrometrijai etapai, jonizavimo metodai proteomikoje, baltymų žemėlapių skaitymas ir duomenų analizė, proteomo tyrimų taikymas.

Pagrindinė literatūra

• Navakauskienė R. 2011. Proteomika ir jos metodai: mokomoji knyga. Vilnius: Technika. 92 p. ISBN: 978-9955-28-885-5.
• Navakauskienė R., D. Navakauskas, V. Borutinskaitė, D.Matuzevičius. Epigenetics and Proteomics of Leukemia – A Synergy of Experimental Biology and Computational Informatics. Published by Springer, 2021, 406 pages, ISBN: 978-3-030-68707-6. https://doi.org/10.1007/978-3-030-68708-3.
• Mishra, Nawin C.; Blobel, Günter; et al. Introduction to Proteomics : Principles and Applications. John Wiley & Sons, Incorporated  2010 ISBN: ISBN number:9780471754022, ISBN number:9780470603864 (https://ebookcentral.proquest.com/lib/viluniv-ebooks/detail.action?docID=510194&query=Proteomics)
• Fuentes, Manuel; LaBaer, Joshua  Caister. Proteomics: Targeted Technology, Innovations and Applications. Academic Press  2014 ISBN: ISBN number:9781908230461, ISBN number:9781908230621 (https://ebookcentral.proquest.com/lib/viluniv-ebooks/detail.action?docID=5897822&query=Proteomics )
• Simpson, R. J. 2002. Proteins and proteomics: a laboratory manual. Cold Spring Harbor (N.Y.): Cold Spring Harbor. Laboratory Press. 926 p. ISBN 0-87969-553-6.
• Svarbiausi tarptautiniai mokslo apžvalginiai straipsniai.

Vertinimo strategija

Vertinimo kriterijai

Egzaminas žodžiu arba seminaras

Egzaminas žodžiu – 3 atviri klausimai;

Seminaras – trukmė 30-45 min.

Vertinimo kriterijai: žinių įsisavinimas ir jų perteikimas, nuosekliai paaiškinant proteomikos ir jos metodų taikymo detales ir specifiką konkrečių uždavinių sprendimui. Nuosekliai ir pagrįstai paaiškinant proteomikos metodų detales ir taikymo specifiką nestandartinių uždavinių sprendimui. Pagrįsti nagrinėtų žinių tinkamumą įvairių gamtos mokslų srities problemų sprendimui, proteomikos žinias laisvai taikant net ir nenagrinėtose, naujose situacijose, demonstruojant žinias bei gebėjimus analizuojant ir pateikiant įžvalgas.

Rūta Navakauskienė

prof.

dr. (HP)

Patvirtinta Gyvybės mokslų centro Doktorantūros mokyklos Tarybos posėdyje 2021-10-14, protokolo Nr. (4.10)600000-KT-....

Tarybos pirmininkė dr. Daiva Baltriukienė