Nukleorūgščių chemija

Dalyko pavadinimas

Mokslo kryptis kodas

Kamieninis padalinys

Šakinis padalinys (-iai)

Nukleorūgščių chemija

Biochemija N 004

Gyvybės mokslų centras

Biotechnologijos institutas

Dalyko apimtis kreditais

6

Studijų būdas

Kreditų skaičius

Studijų būdas

Kreditų skaičius

paskaitos

0

konsultacijos

0,1

individualus

5,9

seminarai

0

Kurso tikslai

Gilus supratimas apie nukleorūgščių cheminę sandarą, jų struktūrą, savybes ir tyrimo metodus.

Pagrindinės temos

Nukleorūgščių (NR) cheminė struktūra, nomenklatūra: heterociklinės bazės, D-ribozė, nukleozidai, nukleotidai; NR tautomerija, rotacinė izomerija; bazių poravimasis, dvigrandė DNR ir RNR; NR hibridizacija, lustų technologijos; NR spiralinė struktūra; žiedinių DNR molekulių topologija, DNR kompaktizacija nukleosomose; NR triguba spiralė; sankirtos, kvadrupleksai, PNR; RNR struktūra; NR komponentų analizė; sekoskaitos technogijų raida ir genomų sekvenavimas; PGR principai; NR ir jų komponentų cheminės savybės; NR cheminė sintezė ir žymėjimas; nekovalentinė NR sąveika su mažom molekulėm, interkaliacija; NR aptamerai, SELEX technologijos; NR nanoinžinerija; epigenetinės DNR modifikacijos ir jų analizė.

Pagrindinė literatūra

• Nukleorūgščių chemija. S. Klimašauskas, V.: Technologjja, 2008 (pdf formate). ISBN 978-9955-25-478-2
• Nucleic acids in chemistry and biology (3rd edition). Blackburn G.M., Gait M.J., Lokes D., Williams D.M. RCS Publishing; Cambridge, 2007. ISBN: 978-0-85404-654-6. https://pubs.rsc.org/en/content/ebook/978-0-85404-654-6
• Understanding DNA. The Molecule and how it works. (3rd edition). C.R Calladine, H.R. Drew, B.F. Luisi, A.A. Travers. Elsevier Academic Press. 2004. ISBN 0-12-155089-3. https://www.sciencedirect.com/book/9780121550899/understanding-dna
• Oxford Handbook of Nucleic Acid Structure. S.Neidle (ed.) Oxford University Press, New York. 1999. ISBN 0-19-850036-6.
• Principles of Nucleic Acids Structure. Saenger, W. Springer-Verlag, 1984. https://www.springer.com/gp/book/9781461251903

Vertinimo strategija

Vertinimo kriterijai

Seminaras

Seminaro trukmė 45-60 min, seminaro metu aptartų mokslinių straipsnių skaičius >30

Saulius Klimašauskas

prof.

habil. dr.

Virginijus Šikšnys

prof.

dr.

Patvirtinta Gyvybės mokslų centro Doktorantūros mokyklos Tarybos posėdyje 2021-10-14, protokolo Nr. (4.10)600000-KT-....

Tarybos pirmininkė dr. Daiva Baltriukienė